CLUSTAL W alignment of phytoplasma Dihydropteroate synthase gene:


Paulownia          TAAGCGAAGACCGTATCAGCACGGTCTTTTCTTTTTTT-CTTTGACATTTATTTTAGAAA 59
Maize              TAAGCGAAGACCGTATCAGCACGGTCTTTTCTTTTTTTTCCTTGACATTTATTTTAGAAA 60
Chrysanthemum      TAAGCGAAGACCGTATCAGCACGGTCTTTTCTTTTTTT-CCTTGACATTTATTTTAGAAA 59
AY1                TAAGCGAAGACCGTATCAGCACGGTCTTTTCTTTTTTT-CCTTGACATTTATTTTAGAAA 59
Garland            TAAGCGAAGACCGTATCAGCACGGTCTTTTCTTTTTTT-CCTTGACATTTATTTTAGAAA 59
Ipomoea            TAAGCGAAGACCGTATCAGCACGGTCTTTTCTTTTTTT-CCTTGACATTTATTTTATAAA 59
Aster              TAAGCGAAGACCGTATCAGCACGGTCTTTTCTTTTTTC---TTGATATTTATTTTAGAAA 57
Tomato             TAAGCGAAGACCGTATCAGCACGGTCTTTTCTTTTTTC---TTGATATTTATTTTAGAAA 57
                   *************************************    **** ********** ***

Paulownia          AAGATTAATTTGTTATAAAAATATCTATTTTAATAACCC----CCCTAGCCTTATTATTT 115
Maize              AAGATTAATTTGTTATAAAAATATCTATTTTAATAACCC----CCCTAGCCTTATTATTT 116
Chrysanthemum      AAGATTAATTTGTTATAAAAATATCTATTTTAATAACCC----CCCTAGCCTTATTATTT 115
AY1                AAGATTAATTTGTTATAAAAATATCTATTTTAATAACCC----CCCTAGCCTTATTATTT 115
Garland            AAGATTAATTTGTTATAAAAATATCTATTTTAATAACCC----CCCTAGCCTTATTATTT 115
Ipomoea            AAGATTAATTTGTTACAAAAATATCTATTTTAATAACCC----CC-TATCCTTATTATTT 114
Aster              AAGATTAATTTATTACAAAAAAATTTATATTAATAAAATAAAATCCTAAAATTATTATTT 117
Tomato             AAGATTAATTTATTACAAAAAAATTTATATTAATAAAATAAAATCCTAAAATTATTATTT 117
                   *********** *** ***** ** *** *******        * **   *********

Paulownia          TTTTC-TAAAATCAATTGATGAAAAAACATTTTTT-GTGTCTTTTGGCAACCCTCTTTAA 173
Maize              TTTTC-TAAAATTAATTGATGAAAAAACATTTTTT-GT--CTTTTGGCAACCCTCTTTAA 172
Chrysanthemum      TTTTC-TAAAATGAATTTATGAAAAAACATTTTTT-GTGTCTTTTGGCAACCCTCTTTAA 173
AY1                TTTTC-TAAAATGAATTTATGAAAAAACATTTTTT-GTGTCTTTTGGCAACCCTCTTTAA 173
Garland            TTTTC-TAAAATGAATTGATGAAAAAACATTTTTT-GTGTCTTTTGGCAATCCTCTTTAA 173
Ipomoea            TTTTC-TAAAATGAATTGATGAAAAAACATTTTTT-GTGTCTTTTGGCAACCCTCTTTAA 172
Aster              TTTTTATAAAATGAATTGATGAAAAAACATTTTTTTGTGTCTTTTGGTAACGTTCTTTAA 177
Tomato             TTTTTATAAAATGAATTGATGAAAAAACATTTTTTTGTGTCTTTTGGTAACGTTCTTTAA 177
                   ****  ****** **** ***************** **  ******* **   *******

Paulownia          TAATAAACATCTT-TGGGCAAAATAACTTTATTCCAATTCTTAAAATTATAAAACATAGA 232
Maize              TAATAAACATCTT-TGGGCAAAATAACTTTATTCCAATTCTTAAAATTATAAAACATAGA 231
Chrysanthemum      TAATAAACATCTT-TTGGCAAAATAACTTTATTCCAATTCTTAAAATTATAAAACATAGA 232
AY1                TAATAAACATCTT-TTGGCAAAATAACTTTATTCCAATTCTTAAAATTATAAAACATAGA 232
Garland            TAATAAACATCTT-TCGGCAAAATAACTTTATTCCAATTCTTAAAATTATAAAACATAGA 232
Ipomoea            TAATAAACATCTTCTGGGCAAAATAACTTTATTCCAATTCTTCAAATTATAAAATATAGA 232
Aster              TGATAAAAATTTC---------------------------------TTTTAG-------- 196
Tomato             TGATAAAAATTTC---------------------------------TTTTAG-------- 196
                   * ***** ** *                                  ** **         

Paulownia          TATAAAGGTAACCAATTTTATGATGGGACTTAACAATCAAACAATTAATTTCTATTCCAA 292
Maize              TATAAAGGTAACCAAGTTTATGATGGGACTTAACAATCAAACAATTAATTTCTATTCCAA 291
Chrysanthemum      TATAAAGGTAACCAAGTTTATGATGGGACTTAACAATCAAACAATTAATTTATATTCCAA 292
AY1                TATAAAGGTAACCAAGTTTATGATGGGACTTAACAATCAAACAATTAATTTATATTCCAA 292
Garland            TATAAAGGTAACCAAGTTTATGATGGGACTTAACAATCAAACAATTAATTTCTATTCCAA 292
Ipomoea            TATAAAGGTAACCAAGTT-ATGATGGGACTTAACAATCAAACAATTAATTTCTATTCCAA 291
Aster              --TAAAA--------------------------------------TAATTTCTATTTCAA 216
Tomato             --TAAAA--------------------------------------TAATTTCTATTTCAA 216
                     ****                                       ****** **** ***

Paulownia          ACACCC--TAAAATATGGAAACTGGCTCACAACCGCCAAATTGAAATTTCTCATAAAGCC 350
Maize              ACACCC--TAAAATATGGAAACTGGCTCACAACCGCCAAATTGAAATTTCTCATAAAGCC 349
Chrysanthemum      ACACCC--TAAAATATGGAAACTGGCTCACAACCGCCAAATTGAAATTTCTCATAAATCC 350
AY1                ACACCC--TAAAATATGGAAACTGGCTCACAACCGCCAAATTGAAATTTCTCATAAATCC 350
Garland            ACACCC--TAAAATATGGAAACTGGCTCATAACCGCCAAATTGAAATTTCTCATAAAGCC 350
Ipomoea            ACACCCCCTAAAATATGGAAACTGGCTCACAACCACCAAATTGAAATTTCTCATAAAGCC 351
Aster              ACATCCT-AAAAATATGGAAACTGTCTCACAAACGCCAAATTGAAATCTTTCATAAAGCC 275
Tomato             ACATCCT-AAAAATATGGAAACTGTCTCACAAACGCCAAATTGAAATCTTTCATAAAGCC 275
                   *** **   *************** **** ** * ************ * ******* **

Paulownia          TTAATTATGGCAATTATTAATGTTACTCCTGATTCTTTTTCAGATGGGACCCAACATTTT 410
Maize              TTAATTATGGCAATTATTAATGTTACTCCTGATTCTTTTTCAGATGGGAACCAACATTTT 409
Chrysanthemum      TTAATTATGGCAATTATTAATGTTACTCCTGATTCTTTTTCAGATGGAAACCAACATTTT 410
AY1                TTAATTATGGCAATTATTAATGTTACTCCTGATTCTTTTTCAGATGGAAACCAACATTTT 410
Garland            TTAATTATGGCAATTATTAATGTTACTCCTGATTCTTTTTCAGATGGAAACCAACATTTT 410
Ipomoea            TTAATTATGGCAATTATTAATGTTACTCCTGATTCTTTTTCAGATGGAAACCAACATTTT 411
Aster              TTAATTATGGCAATTATTAATGTTACTTCTGATTCTTTTTCATATGGCAACCAACATTTT 335
Tomato             TTAATTATGGCAATTATTAATGTTACTTCTGATTCTTTTTCATATGGCAACCAACATTTT 335
                   *************************** ************** **** * **********

Paulownia          ACTACTCAAAAAGCAGTTAATCATGCTCTTCTTTGTCTCAAAGAAGGTACTGATATCATT 470
Maize              ACTACTCAAAAAGCAGTTAATCATGCTCTTCGTTGTCTCAAAGAAGGTGCTGATATCATT 469
Chrysanthemum      ACTACTCAAAAAGCAGTTAATCATGCTCTTCGTTGTCTCAAAGAAGGTGTTGATATCATT 470
AY1                ACTACTCAAAAAGCAGTTAATCATGCTCTTCGTTGTCTCAAAGAAGGTGTTGATATCATT 470
Garland            ACTACTCAAAAAGCAGTTAATCATGCTCTTCGTTGTCTCAAAGAAGGTGCTGATATCATT 470
Ipomoea            ACCACTCAAAAAGCAGTTAATCATGCTCTTCGTTGTCTCAAAGAAGGTGCTGATATCCTT 471
Aster              GCCACTCAAAAAGCAGTTAAACATGCTCTTTGTTGTCTCAAAGAAGGTGCTGATATCCTT 395
Tomato             GCCACTCAAAAAGCAGTTAAACATGCTCTTTGTTGTCTCAAAGAAGGTGCTGATATCCTT 395
                    * ***************** *********  ****************  ******* **

Paulownia          GATATTGGAGGCGAATCCACTCGTCCAGGAGCAATCCCAATTACTCCTTTAGAAGAACAA 530
Maize              GATGTTGGAGGCGAATCTACTCGTCCAGGAGCAATCCCAATTACTCCTTTAGAATAACAA 529
Chrysanthemum      GATATTGGAGGCGAATCTACTCGTCCAGGAGCAATCCCAATTACTCCTTTAGAAGAACAA 530
AY1                GATATTGGAGGCGAATCTACTCGTCCAGGAGCAATCCCAATTACTCCTTTAGAAGAACAA 530
Garland            GATATTGGAGGCGAATCTACTCGTCCAGGAGCAATCCCAATTACTCCTTTAGAAGAACAA 530
Ipomoea            TATGTTGGAGGCGAATCTACTCATCCAGGAGCAATCCCAATTACTCCTTTAGAAGAACAA 531
Aster              GATATTGGATGCGAATTTACTCGCCCAGGAGCAACTCTAATTACTCCTTTAGAAGAACAA 455
Tomato             GATATTGGATGCGAATTTACTCGCCCAGGAGCAACTCTAATTACTCCTTTAGAAGAACAA 455
                    ** ***** ******  ****  **********  * **************** *****

Paulownia          AAACGCATTTTGCCTGTTATTAAAGAATTATCGCGTCATCCTAAAGCCATTATTTCTGTT 590
Maize              AAACGCATTTTGCCTGTTATTAAAGAATTATCACGTCATCCTAAAGCCATTATTTCTGTT 589
Chrysanthemum      AAACGCATTTTGCCTGTTATTAAAGAATTATCACGTCATCCTAAAGCCATTATTTCTGTT 590
AY1                AAACGCATTTTGCCTGTTATTAAAGAATTATCACGTCATCCTAAAGCCATTATTTCTGTT 590
Garland            AAACGCATTTTGCCTGTTATTAAAGAATTATCACGTCATCCTAAAGCCATTATTTCTGTT 590
Ipomoea            AAACGCATTTTGCCTGTTATTAAAAAATTATCACGTCATCCTAAAGCCATTATCTCTGTT 591
Aster              AAACCCATTTTGCATGTTATTAAAGAATTATCGCACCACCCCAAAGCCATTATCTCTGTT 515
Tomato             AAACCCATTTTGCATGTTATTAAAGAATTATCGCACCACCCCAAAGCCATTATCTCTGTT 515
                   **** ******** ********** ******* *  ** ** *********** ******

Paulownia          GATACTTATCATTTTCAAACCGCTAAATTAGCCATTAAAGCAGGAGCTCATATTATCAAT 650
Maize              GATACTTATCATTTTCAAATCGCTAAATTAGCCATTAAAGCAGGAGCTCATATTATCAAT 649
Chrysanthemum      GATACTTATCATTTTCAAACCGCTAAATTAGCCATTAAAGCTGGAGCTCATATTATCAAT 650
AY1                GATACTTATCATTTTCAAACCGCTAAATTAGCCATTAAAGCTGGAGCTCATATTATCAAT 650
Garland            GATACTTATCATTTTCAAACCGCTAAATTAGCCATTAAAGCAGGAGCTCATATTATCAAT 650
Ipomoea            GACACTTATCATTTTCAAACCGCTAAATTATCCATTAAAGCAAAAGCTCATATTATCAAT 651
Aster              TATACTTATCATTTTCAAATTGCTAAATTAGCCATTAAATCAGGAGCTCATATTATCAAT 575
Tomato             TATACTTATCATTTTCAAATTGCTAAATTAGCCATTAAATCAGGAGCTCATATTATCAAT 575
                    * ****************  ********* ******** *   ****************

Paulownia          GATGTTT-GTGGTTTGCAACAAAATCCTCAAATGGCACAAA-CAATTGCCTCATTAAATG 708
Maize              GATGTTT-GTGGTTTGCAACAAAATCCTCAAATGGCACAAA-CAATTGCCTCATTAAATG 707
Chrysanthemum      GATGTTT-GTGGCTTGCAACAAAATCCTCAAATGGCACAAA-CAATTGCCTCATTAAATG 708
AY1                GATGTTT-GTGGCTTGCAACAAAATCCTCAAATGGCACAAA-CAATTGCCTCATTAAATG 708
Garland            GATGTTT-GTGGCTTGCAACAAAATCCTCAAATGGCACAAA-CAATTGCCTCATTAAATG 708
Ipomoea            GATTTTT-GTGGCTTGCAACAAAATCCTCAAATGGCACAAAACAATTACCTCATTAAATG 710
Aster              GATGTTTAGTGGATTTCAACAAAATCATCAAATGGCAAAAA-CAATTGCTGCATTAAATG 634
Tomato             GATGTTTAGTGGATTTCAACAAAATCATCAAATGGCAAAAA-CAATTGCTGCATTAAATG 634
                   *** *** **** ** ********** ********** *** ***** *  *********

Paulownia          CAGGTGTTTGTATTATGCATACAGGC--AGAAATCGCAAAAAACTTTCTAATGCCTTGCA 766
Maize              CAGGTGTTTGTATTATGCATACAGGCGCAGAAATCGCAAAAAACTTTCTAATGCCTTGCA 767
Chrysanthemum      CAGGTGTTTGTATTATGCATACAGGC--AGAAATCGCAAAAAACTTTCTAATGCCTTGCA 766
AY1                CAGGTGTTTGTATTATGCATACAGGC--AGAAATCGCAAAAAACTTTCTAATGCCTTGCA 766
Garland            CAGGTGTTTGTATTATGCATACAGGC--AGAAATCGCAAAAAACTTTCTAATTCCTTGCA 766
Ipomoea            CAGGTGTTTGTATTATGCATACAGGCATAGAAATCGCAAAAAACTTTCTAATGCCTTGCA 770
Aster              AAGGCGTTTGCATTATTCATACAGGC--AGAACTCACAAAAACCTTTCTAATAAATTGCA 692
Tomato             AAGGCGTTTGCATTATTCATACAGGC--AGAACTCACAAAAACCTTTCTAATAAATTGCA 692
                    *** ***** ***** *********  **** ** ****** *********   *****

Paulownia          AGACCAATTTTATTTTTTAAATCATTCCTTAGAAATTGCCAAACAAGCCCAAATTGCAAC 826
Maize              AGACCAATTTTATTTTTTAAATCATTCCTTAGAAATTGCCAAACAAGCCCAAATTGCAAC 827
Chrysanthemum      AGACCAATTTTATTTTTTAAATCATTCCTTAGAAATTGCCAAACAAGCCCAAATTGCAAC 826
AY1                AGACCAATTTTATTTTTTAAATCATTCCTTAGAAATTGCCAAACAAGCCCAAATTGCAAC 826
Garland            AGACCAATTTTATTTTTTAAATCATTCCTTAGAAATTGCCAAACAAGCCCAAATTGCAAC 826
Ipomoea            AGACCAATTTTATTTTTTAAATCATTCCTTAGAAATTACCAAACAAGCCCAAATTGCAAC 830
Aster              AGACCAATTTTATTTTT-AAATCATTCCTTACAAATTGCCAAACAAGCTCAAATTGCAAC 751
Tomato             AGACCAATTTTATTTTT-AAATCATTCCTTACAAATTGCCAAACAAGCTCAAATTGCAAC 751
                   ***************** ************* ***** ********** ***********

Paulownia          AGAGGCAATAGTAATTGACCCTGGGTTTGGTTTT-GAAAAAAACATTGATGAAAACTTTG 885
Maize              AGAGGCAATAGTAATTGACCCTGGGTTTGGTTTTTGAAAAAAACATTGATGAAAACTTTG 887
Chrysanthemum      AGAGGCAATAGTAATTGACCCTGGGTTTGGTTTT-GAAAAAAACATTGATGAAAACTTTG 885
AY1                AGAGGCAATAGTAATTGACCCTGGGTTTGGTTTT-GAAAAAAACATTGATGAAAACTTTG 885
Garland            AGAGGCAATAGTAATTGACCCTGGGTTTGGTTTT-GAAAAAAACATTGATGAAAACTTTG 885
Ipomoea            AGAGGCAATAGTAATTGACACTGGGTTTGGTTTT-GAAAAAAACATTGATGAAAACTTTG 889
Aster              AGAGGAAATAGTGATGAATCCTTGATTTATTTTT-TTAAAAAATATTGATGAAAACTTTG 810
Tomato             AGAGGAAATAGTGATGAATCCTTGATTTATTTTT-TTAAAAAATATTGATGAAAACTTTG 810
                   ***** ****** **  *  ** * ***  ****   ****** ****************

Paulownia          ATATTATAAAAGAATTTGAGCAATTAACTAAAATGGAACT-ACCCATATTGGTAGGTCTT 944
Maize              ATATTATAAAAGAATTTGAGCAATTAACTAAAATGGAACT-ACCCATATTGGTAGGTCTT 946
Chrysanthemum      ATATTATAAAAGAATTTGAGCAATTAACTAAAATGGAACT-ACCCATATTGGTAGGTCTT 944
AY1                ATATTATAAAAGAATTTGAGCAATTAACTAAAATGGAACT-ACCCATATTGGTAGGTCTT 944
Garland            ATATTATAAAAGAATTTGAGCAATTAACTAAAATGGAACT-GCCCATATTGGTAGGTCTT 944
Ipomoea            ATATTATAAAAGAATTTGAGCAATTAACTAAAATGGAACT-GCCTATATTGGTAGGTCTT 948
Aster              ATATTATAAAAGATTTTGAATAATTAACTAAAATGGGAATGACCTATATTGGTAGGTCTT 870
Tomato             ATATTATAAAAGATTTTGAATAATTAACTAAAATGGGAATGACCTATATTGGTAGGTCTT 870
                   ************* *****  *************** * *  ** ***************

Paulownia          TCGCGTAAAAGATTTCTTAAAGCAATAATTCCAA-CTGAAAGCCTTTTGCAAGTAGAATC 1003
Maize              TCACGTAAAAGATTTCTTAAAGCAATAATTCCAA-CTGAAAGCCTTTTGCAAGTAGAATC 1005
Chrysanthemum      TCACGTAAAAGATTTCTTAAAGCAATAATTCCAA-CTGAAAGCCTTTTGCAAGTAGAATC 1003
AY1                TCACGTAAAAGATTTCTTAAAGCAATAATTCCAA-CTGAAAGCCTTTTGCAAGTAGAATC 1003
Garland            TCACGTAAAATATTTCTTAAAGCAATAATTCCAA-CTGAAAGCCTTTTGCAAGTAGAATC 1003
Ipomoea            TCACGTAAAAGATTTCTTCAAGCAATAATTCAAA-CTGAAGGCCTTTTGCAAGTAGAATC 1007
Aster              TCTCGCAAAAGATTTTTCCAAGCTATAATTAAAAACTGAAGGCATTTTGTAAGTATAATC 930
Tomato             TCTCGCAAAAGATTTTTCCAAGCTATAATTAAAA-CTGAAGGCATTTTGTAAGTATAATC 929
                   ** ** **** **** *  **** ******  ** ***** ** ***** ***** ****

Paulownia          ATTAGATGCCATTACTGCTAATGCT--AATTTTTTGTTAAGAACTAAAGGAGCTTCGATT 1061
Maize              ATTAGATGCCATTACTGCCACTGCT--AATTTTTTGTTAAGAACTAAAGGAGCTTCGATT 1063
Chrysanthemum      ATTAGATGCCATTACTGCTACTGCT--AATTTTTTGTTAAGAACTAAAGGAGCTTCGATT 1061
AY1                ATTAGATGCCATTACTGCTACTGCT--AATTTTTTGTTAAGAACTAAAGGAGCTTCGATT 1061
Garland            ATTAGATGCCATTACTGCTACTGCT--AATTTTTTGTTAAGAACTAAAGGAGCTTCGATT 1061
Ipomoea            ATTAGATGCCATTACTGCTACTGCT--AATTTTTTGTTAAGAACTAAAGGAGCTTCGATT 1065
Aster              TTTAGAAGCCATTACTGATGCTGCTCTAATTTTTTGTTAAGAACTAAAGGGGCTTCGATT 990
Tomato             TTTAGAAGCCATTACTGATGCTGCTCTAATTTTTTGTTAAGAACTAAAGGGGCTTCGATT 989
                    ***** **********    ****  *********************** *********

Paulownia          TTTCGAGTGCATAATGTCAAAATGAATAAAAATAGTTTGCTTTT---AGCAGATACTTTA 1118
Maize              TTTCGAGTACATAATGTCAAAATGAATAAAAATAGTTTGCTTTTTTTAGCAGATACTTTA 1123
Chrysanthemum      TTTCGAGTGCATAATGTCAAAATGAATAAAAATAGTTTGCTTTT---AGCAGATACTTTA 1118
AY1                TTTCGAGTGCATAATGTCAAAATGAATAAAAATAGTTTGCTTTT---AGCAGATACTTTA 1118
Garland            TTTCGAGTGCATAATGTCAAAATGAATAAAAATAGTTTGCTTTT---AGCAGATACTTTA 1118
Ipomoea            TTTCGAGTGCATAATGTCAAAATGAATAAAAATAGTTTGCTTTT---AGCAGATACTTTA 1122
Aster              TTTTGAGTGCATAATGTCAAAATTAATCAAAATAGTTTGCTTTT---GAGATATACTTTA 1047
Tomato             TTTTGAGTGCATAATGTCAAAATTAATCAAAATAGTTTGCTTTT---GAGATATACTTTA 1046
                   *** **** ************** *** ****************      * ********

Paulownia          ATGAAAAAAATATAAATATTGTTATCCTAAATATATTTTAAAA-TTATCCCTTTTAAAAT 1177
Maize              ATGAAAAAAATACAAATATTGTTATCCTAAATATATTTTAAAA-TTATCCCTTTTAAAAT 1182
Chrysanthemum      ATGAAAAAAATATAAATATTGTTATCCTAAATATATTTTAAAA-TTATCCCTTTTAAAAT 1177
AY1                ATGAAAAAAATATAAATATTGTTATCCTAAATATATTTTAAAA-TTATCCCTTTTAAAAT 1177
Garland            ATGAAAAAAATATAAATATTGTTATCCTAAATATATTTTAAAA-TTATCCCTTTTAAAAT 1177
Ipomoea            ATGAAAAAAATATAAATATTGTTATCCTAAATATATTTTAAAA-TTATCCATTT-AAAAT 1180
Aster              ATGAAAAAA-TATAAATATTATTAT---AAATATATTTTAAAAATTATCACTTTTAAAAG 1103
Tomato             ATGAAAAAA-TATAAATATTATTAT---AAATATATTTTAAAAATTATCACTTTTAAAAG 1102
                   ********* ** ******* ****   *************** *****  *** **** 

Paulownia          AATGAAAAACATTAATTTTTGCAACATAAAAAACGCAAATAAAACACATTTTAAAAAAAA 1237
Maize              AATGAAAAACATTAATTTTTGCAACATAAAAAACGCAAATAAAACACATTTTTAAAAAAA 1242
Chrysanthemum      AATGAAAAACATTAATTTTTGCAACATAAAAAACGCAAATAAAACACATTTTTAAAAA-- 1235
AY1                AATGAAAAACATTAATTTTTGCAACATAAAAAACGCAAATAAAACACATTTTTAAAAA-- 1235
Garland            AATGAAAAACATTAATTTTTGCAACATAAAAAACGCAAATAAAACACATTTTTAAAAAA- 1236
Ipomoea            AATGAAAAACATTAATTTTTGCAACATAAAAAACGTAAACAAAACACATTTTTAAAAAAA 1240
Aster              AATGAAAAAAATTAATTTTTGCAACATAAAAAACGTAAACAAAACACATTCTTAAAAAA- 1162
Tomato             AATGAAAAAAATTAATTTTTGCAACATAAAAAACGTAAACAAAACACATTCTTAAAAAA- 1161
                   ********* ************************* *** ********** * *****  

Paulownia          AGAATTTATGACTTGTCAAACTTATCAAATATTTTTCTAAAAACAAATATTTTGCAAACA 1297
Maize              AGAATTTATGACTTGTCAAACTTATCAAATATTTTTCTAAAAACAAATATTTTGCAAACA 1302
Chrysanthemum      AGAATTTATGACTTGTCAAACTTATCAAATATTTTTCTAAAAACAAATATTTTGCAAACA 1295
AY1                AGAATTTATGACTTGTCAAACTTATCAAATATTTTTCTAAAAACAAATATTTTGCAAACA 1295
Garland            AGAATTTATGACTTGTCAAACTTATCAAATATTTTTCTAAAAACAAATATTTTGCAAACA 1296
Ipomoea            GGAATTTATGACTTGTCAAACTTATCAAATATTTTTCTAAAAACAAATATTTTGCAAACA 1300
Aster              GGAATTTATTACTTGTCAAACTTATTAAATATTTTTC-AAAAACAAATATTTTGCCAA-- 1219
Tomato             GGAATTTATTACTTGTCAAACTTATTAAATATTTTTC-AAAAACAAATATTTTGCCAA-- 1218
                    ******** *************** *********** ***************** **  

Paulownia          TTTTTCTATTTTTTATAACTATACCCAAGTAAAGAACGTATAAAACAATGAAACTTAATA 1357
Maize              TTTTTCTATTTTTTATAACTATACCCAAGTAAAGAACGTATAAAACAATGAAACTTAATA 1362
Chrysanthemum      TTTTTCTATTTTTTATAACTATACCCAAGTAAAGAACGTATAAAACAATGAAACTTAATA 1355
AY1                TTTTTCTATTTTTTATAACTATACCCAAGTAAAGAACGTATAAAACAATGAAACTTAATA 1355
Garland            TTTTTCTATTTTTTATAACTATACCCAAGTAAAGAAGGTATAAAACAATGAAACTTAATA 1356
Ipomoea            TTTTTCTATTTTTTACAACTATACCAAAGTAAAGAACGTATAAAACAATTAAACTTAGTA 1360
Aster              ------TTTTGTTTACAATTATACACAAGTAAAGAACCCACAAAACAA------------ 1261
Tomato             ------TTTTGTTTACAATTATACACAAGTAAAGAACCCACAAAACAA------------ 1260
                         * ** **** ** *****  **********   * *******            

Paulownia          ACAATGTAGCAGCCATAGGACTTGGTAGTAATCTGGGAGCTAAAAAGAATAATTTACAAA 1417
Maize              ACAATGTAGCAGCCATAGGACTTGGTAGTAATCTGGGAGCTAAAAAGAATAATTTACAAA 1422
Chrysanthemum      ACAATGTAGCAGCCATAGGACTTGGTAGTAATCTGGGAGCTAAAAAGAATAATTTACAAA 1415
AY1                ACAATGTAGCAGCCATAGGACTTGGTAGTAATCTGGGAGCTAAAAAGAATAATTTACAAA 1415
Garland            ACCATGTAGCAGCCATAGGACTTGGTAGTAATCTGGGAGCTAAAAAGAATAATTTACAAA 1416
Ipomoea            ACAATGTAGCAGCCATAGGACTTGGTAGTAATCTAGGAGCTAAAAAGAATAATTTACAAA 1420
Aster              ------------------------------------------------------------
Tomato             ------------------------------------------------------------
                                                                               

Paulownia          CTGCTTTAAAAATGATTAATTTCCATCCTCAATGCGAAGTTTTGAAAGTTTCTCCTTTGT 1477
Maize              CTGCTTTAAAAATGATTAATTTGCATCCTCAATGCGAAGTTTTGAAAGTTTCTCCTTTGT 1482
Chrysanthemum      CTGCTTTAAAAATGATTAATTTGCATCCTCAATGCGAAGTTTTGAAAGTTTCTCCTTTGT 1475
AY1                CTGCTTTAAAAATGATTAATTTGCATCCTCAATGCGAAGTTTTGAAAGTTTCTCCTTTGT 1475
Garland            CTGCTTTAAAAATGATTAATTTGCATCCTCAATGCGAATTTTTGAAAGTTTCTCCTTTGT 1476
Ipomoea            CTGCTTTAAAAATGATTAATTTGCATCCTCAATGCGAAGTTTTGAAAGTTTCTCCTTTGT 1480
Aster              -----------ATGATTAATTCGCATCCTAAATGCGAAGTTTTGAAAGTTTTTACTTTGT 1310
Tomato             -----------ATGATTAATTCGCATCCTAAATGCGAAGTTTTGAAAGTTTTTACTTTGT 1309
                              **********  ****** ******** ************ * ******

Paulownia          ATGAAACTCTTCCTTGGGG-AAAAACAGACCAACCTTTATTTTTAAACGCTGCTGCTCTT 1536
Maize              ATGAAACTCTTCCTTGGGGGAAAAACAGACCAACCTTTATTTTTAAACGCTGCTGCTCTT 1542
Chrysanthemum      ATGCAACTCTTCCTTGGGG-AAAAACAGACCAACCTTTATTTTTAAACGCTGCTGCTCTT 1534
AY1                ATGCAACTCTTCCTTGGGG-AAAAACAGACCAACCTTTATTTTTAAACGCTGCTGCTCTT 1534
Garland            ATGAAACTCTTCCTTGGGG-AAAAACAGACCAACCTTTATTTTTAAACGCTGCTGCTCTT 1535
Ipomoea            ATGAAACTCTTCCTTGGGG-AAAAACAGACCAACCTTTATTTTTAAACGCTGCTGCTCTT 1539
Aster              ATGAAACTTTTCCTTGTAAAAAAAACATACTAACCTTTATTTTTAAAAGCTGCTTTTCTA 1370
Tomato             ATGAAACTTTTCCTTGTAAAAAAAACATACTAACCTTTATTTTTAAAAGCTGCTTTTCTA 1369
                   *** **** *******    ******* ** **************** ******  *** 

Paulownia          ATCAAAACTTTCCTACCTCCCTTACTTTTTTTAGATTTTTTATTATCTGTAGAAATGAAA 1596
Maize              ATCAAAACTTTCCTACCTCCCTTACTTTTTTTAGATTTTTTATTATCTGTAGAAATGAAA 1602
Chrysanthemum      ATCAAAACTTTCCTACCTCCCTTACTTTTTTTAGATTTTTTATTATCTGTAGAAATGAAA 1594
AY1                ATCAAAACTTTCCTACCTCCCTTACTTTTTTTAGATTTTTTATTATCTGTAGAAATGAAA 1594
Garland            ATCAAAACTTTCCTACCTCCCTTACTTTTTTTAGATTTTTTATTATCTGTAGAAATGAAA 1595
Ipomoea            ATCAAAACTTTGGACAACTTTTTACTTTTTTTAGATTTTTTATTATCTGTAGAAATGAAG 1599
Aster              ATCAAAACTACCTTATCCCTTTTACTTTTTT--AGTTTTTTATTATCTGTAAAAATGAAG 1428
Tomato             ATCAAAACTACCTTATCCCTTTTACTTTTTT--AGTTTTTTATTATCTGTAAAAATGAAG 1427
                   *********            **********    **************** ******* 

Paulownia          CTCAAAAGAAAACGACTGGGATTATGGGGACCGCGTACTATTGATTTAGATATTTTGTTT 1656
Maize              CTCAAAAGAAAACGACTGGAATTATGGGGACTGCGTACTATTGATTTAGATATTTTGTTT 1662
Chrysanthemum      CTCAAAAGAAAACGACTAGAATTATGGGGACCGCGTACTATTGATTTAGATATTTTGTTT 1654
AY1                CTCAAAAGAAAACGACTAGAATTATGGGGACCGCGTACTATTGATTTAGATATTTTGTTT 1654
Garland            CTTAAAAGAAAACGACTGGAATTATGGGGACCGCGTACTATTGATTTAGATATATTGTTT 1655
Ipomoea            CTCAAAAGAAAACGACTGGAATTATGGGGACCGCGTACTATTGATTTAGATATTTTGTTT 1659
Aster              CTCAAAATAAAACACATGGAATTATTGGTTCCACTTACTATTGATTTAGATATTTTGTTT 1488
Tomato             CTCAAAATAAAACACATGGAATTATTGGTTCCACTTACTATTGATTTAGATATTTTGTTT 1487
                   ** **** *****   * * ***** **  *  * ****************** ******

Paulownia          TTGGGTAATCATACTTGCAAAACTCCTAAATTAACTATTCCTCATCCCTATATGTTAGAA 1716
Maize              TTGGGTAATCATACTTGCAAAACTCCTAAATTAACTATTCCTCATCCCTATATGTTAGAA 1722
Chrysanthemum      TTGGGTAATCATACTTGCAAAACTCCTAAATTAACTATTCCTCATCCCTATATGTTAGAA 1714
AY1                TTGGGTAATCATACTTGCAAAACTCCTAAATTAACTATTCCTCATCCCTATATGTTAGAA 1714
Garland            TTGGGTAATCACACTTGCAAAACTCCTAAATTAACTATTCCTCATCCCTATATGTTAGAA 1715
Ipomoea            TTTGGTAATCATACTTGCAAAACTCCTAAATTAACTATTCCTCATCCCTATATGTTAGAA 1719
Aster              TTTGGTAATCACACTTGTAAAAATCCTAAATTAACTATTCCTCATCCATATATGTTAGAA 1548
Tomato             TTTGGTAATCACACTTGTAAAAATCCTAAATTAACTATTCCTCATCCATATATGTTAGAA 1547
                   ** ******** ***** **** ************************ ************

Paulownia          AGAATTTTTGTCCTTGCTCCCTTAGCAGATATTTTGCCTAACCAAATAATACAAACCAAA 1776
Maize              AGAATTTTTGTCCTTGCTCCCTTAGCAGATATTTTGCCTAACCAAATAATACAAACCAAA 1782
Chrysanthemum      AGAATTTTTGTCCTTGCTCCCTTAGCAGATATTTTACCTAACCAAATAATACAAACCAAA 1774
AY1                AGAATTTTTGTCCTTGCTCCCTTAGCAGATATTTTACCTAACCAAATAATACAAACCAAA 1774
Garland            AGAATTTTTGTCCTTGCTCCCTTAGCAGATATTTTGCCTAACCAAATAATACAAACCAAA 1775
Ipomoea            AGAATTTTTGTCCTTACTCTCTTAGCAGATATTTTGCCTAACCAAATAATACAAACCAAA 1779
Aster              AGAATTTTTGTCCTTACTTTTTTAGCAGATATTTTGCCTAACCAAATAACACAAACCAAA 1608
Tomato             AGAATTTTTGTCCTTACTTTTTTAGCAGATATTTTGCCTAACCAAATAACACAAACCAAA 1607
                   *************** **   ************** ************* **********

Paulownia          ACTATTTTAGAATGGAAAAACCAATTAGATCAAAATGCAGTTAAAATAATTGAAAATAAT 1836
Maize              ACTATTTTAGAATGGAAAAACCAATTAGATCAAAATGCAGTTAAAATAATTGAAAATAAT 1842
Chrysanthemum      ACTATTTTAGAATGGAAAAACCAATTAGATCAAAATGCAGTTAAAATAATTGAAAATAAT 1834
AY1                ACTATTTTAGAATGGAAAAACCAATTAGATCAAAATGCAGTTAAAATAATTGAAAATAAT 1834
Garland            ACTATTTTAGAATGGAAAAACCAATTAGATCAAAATGCAGTTAAAATAATTGAAAATAAT 1835
Ipomoea            ACTATTTTAGAATGGGAAAACCAATTAGATCAAAATGCAGTTAAAATAATTGAAAATAAT 1839
Aster              ACTATTTTAGGATGGAAAAACCAATTAGATCAAAATGCAGTTAAAATAATTGAAAATAAT 1668
Tomato             ACTATTTTAGAATGGAAAAACCAATTAGATCAAAATGCAGTTAAAATAATTGAAAATAAC 1667
                   ********** **** ******************************************* 

Paulownia          CAATGGTATCAACCTTCTTTTTAAAAAACCTAACTGTTTCATTTTTAGATAACTTAATTA 1896
Maize              CAATGGTATCAACCTTCTTTTTAAAAAACCTAACTGTTTCATTTTTAGATAACTTAATTA 1902
Chrysanthemum      CAATGGTATCAACCTTCTTTTTAAAAAACCTAACTGTTTCATTTTTAGATAACTTAATTA 1894
AY1                CAATGGTATCAACCTTCTTTTTAAAAAACCTAACTGTTTCATTTTTAGATAACTTAATTA 1894
Garland            CAATGGTATCAACCTTCTTTTTAAAAACCCTAACTGTTTCATTTTTAGATAACTTAATTA 1895
Ipomoea            CAATGGTATCAACCTTCTTTTTAAAAAACCTAACTGTTTCATTTTTAGATAACTTAATTA 1899
Aster              CAATGGTATTAACCTTTTTTAAAAAATTTCTAACTGTTTCATTTTTAGACAACTTAATTA 1728
Tomato             CAATGGTATTAACCTTTTTTAAAAAATTTCTAACTGTTTCATTTTTAGACAACTTAATTA 1727
                   ********* ****** ***  ****   ******************** **********

Paulownia          TTTTAAACTAT-ATTTATTAATGTAAAAATAAAATTGTAAAAA--GGAAATTATATGAAT 1953
Maize              TTTTAAACTAT-ATTTATTAATGTAAAAATAAAATTGTAAAAA--GGAAATTATATGAAT 1959
Chrysanthemum      TTTTAAACTAT-ATTTATTAATGTAAAAATAAAATTATAAAAA--GGAAATTATATGAAT 1951
AY1                TCTTAAACTAT-ATTTATTAATGTAAAAATAAAATTATAAAAA--GGAAATTATATGAAT 1951
Garland            TTTTAAACTAT-ATTTATTAATGTAAAAATAAAATTGTAAAAA--GGAAATTATATGAAT 1952
Ipomoea            TTTTAAACTAT-ATTTATTAATGCAAAAATAAAATTGTAAAAAAAGGAAATTATATGAAT 1958
Aster              TTTAAAAATATCATTTATTAATGTAAAAATAAAATTATATAAA--GGAAATTATATGAAC 1786
Tomato             TTTAAAAATATCATTTATTAATGTAAAAATAAAATTATAAAAA--GGAAATTATATGAAC 1785
                   * * *** *** *********** ************ ** ***  ************** 

Paulownia          ATTTTATCAATCGAAACTAGTTGTGATGAAACGAGTTGTGCAGT 1997
Maize              ATTTTATCAATCGAAACTAGTTGTGATGAAACGAGTTGTGCAGT 2003
Chrysanthemum      ATTTTATCAATCGAAACTAGTTGTGATGAAACGAGTTGTGCAGT 1995
AY1                ATTTTATCAATCGAAACTAGTTGTGATGAAACGAGTTGTGCAGT 1995
Garland            ATTTTATCAATCGAAACTAGTTGTGATGAAACGAGTTGTGCAGT 1996
Ipomoea            ATTTTATCAATCGAAACTAGTTGTGATGAAACGAGTTGTGCAGT 2002
Aster              ATTTTATCAATCGAAACTAGTTGTGATGAAACGAGTTGTGCAGT 1830
Tomato             ATTTTATCAATCGAAACTAGTTGTGATGAAACGAGTTGTGCAGT 1829
                   ********************************************