Blueberry ------------------------------------------------------------
Tomato ------------------------------------------------------------
Clover ATGAACATTTTATCAATTGAAACAAGTTGTGATGAAACGAGTTGTGCAGTTACTGAAAAT 60
Ipomoea ------------------------------------------------------------
Maize ------------------------------------------------------------
Paulownia ------------------------------------------------------------
Aster ------------------------------------------------------------
Candidatus ---------------------------------------------------ACTCAAGAT 9
ulmi ------------------------------------ACGAGCATTGCAGTTGTAAAAGAT 24
Peanut ------------------TACAAGTTGTGGGAAGAAACGAGTATCGCTATTACTCAAGAT 42
Group ------------------------------------------------------------
Blueberry ------------------------------------------------------------
Tomato -------------------------------------------------AAATTTTTGGT 11
Clover GGTAAAAAAGTACTCTCTAATGTAGTTTTTTCCCAAATTAAAGATCATCAAATTTTTGGT 120
Ipomoea ------------CTTTCTAATGTAGTTTTTTCCCAAATTAAAGATCATCAAATTTTTGGT 48
Maize ----------------------------TTTCCCAAATTAAAGATCATCAAATTTTTGGT 32
Paulownia ---------------TCTAATGTAGTTTTTTCCCAAATTAAAGATCATCAAATTTTTGGT 45
Aster -----------------------------------------AGATCATCAAATTTTTGGT 19
Candidatus GGTAAAAAAGTTATTTCTAATATTGTTTTTTCTCAAATTAAAGAACATTCATTAAATGGA 69
ulmi GGCAAAGATATTTTATCTAATGTGATTTTTTCGCAAATAAAATATCATCAAAAATTTGGT 84
Peanut GGAAAAAAAGTATTAGCAAATGAAACTTGTTCGCAAATTAAATGTCATCAAAAATATGGT 102
Group ------------------------------------------------------------
Blueberry --------------------------------------ATTTATGACTTCGGTATTACAA 22
Tomato GGAGTAGTCCCTGAAATAGCTTCTAGAAAACATATTCAATTTATGACCTTGGCATTACAA 71
Clover GGAGTAGTCCCCGAAATAGCTTCTAGAAAACATATTCAATTTATGACTTTGGTATTACAA 180
Ipomoea GGAGTAGTCCCTGAAATAGCTTCTAGAAAACATATTCAATTTATGACTTTGGTATTACAA 108
Maize GGAGTAGTCCCTGAAATAGCTTCTAGAAAACATATTCAATTTATGACTTTGGTATTACAA 92
Paulownia GGAGTAGTCCCTGAAATAGCTTCTAGAAAACATATTCAATTTATGACTTTGGTATTACAA 105
Aster GGAGTAGTCCCTGAAATAGCTTCTAGAAAACATATTCAATTTATGACTTTGGTATTACAA 79
Candidatus GGTGTTATTCCCGAATTAGCTTCTAGAGAACATTTGAAAAATATTACTTTAGTTTTAGAA 129
ulmi GGCGTAGTTCCGGAATTAGCTTCTCGTAAACATGTAGAAATTATTACTTTGGTTTTAGCA 144
Peanut GGTGTAGTTCCTGAAATAGCTTCTAGAAAACATTTAGAAGTGATAACATATCTTTTACAA 162
Group ---------CCCGAAATCGCTTCACGTAAACATGTAGAAACAATTACTTTAATTTTAAAA 51
* ** ** * *** *
Blueberry CAAGCCCTTAAGGAAGCACATTTAACACCCCAAGAAATTGATTTAGTAGCAGTTACCCAA 82
Tomato CAAACCCTTAAAGAAGCACATCTCACACCCCAAGAAATTGATTTAGTAGCAGTTACTCAA 131
Clover CAAGCCCTTAAAGAAGCATATCTCACACCCCAAGAAATTGATTTAGTAGCAGTTACCCAA 240
Ipomoea CAAGCCCTTAAAGAAGCGAACATTACCCCCCAAGAAATTGATTTAGTAGCAGTTACCCAA 168
Maize CAAGCCCTTAAAGAAGCGAACCTTACCCCCCAAGAAATTGATTTAGTAGCAGTTACCCAA 152
Paulownia CAAGCCCTTAAAGAATCGAACCTTACCCCCCAAGAAATTGATTTAGTAGCAGTTACCCAA 165
Aster CAAGCCCTTAAAGAAGCGAACCTTACCCCCCAAGAAATTGATTTAGTAGCAGTTACCCAA 139
Candidatus AAATCTTTAAAAGAAGCTAATATTCAACCTCAAGAAATTGACTTAGTTGCATTTACTCAA 189
ulmi GAAGCTTTAAGAAAAGCTCAAATAAATCCTCGAGAAATTGATTTGGTAGCTGTAACTCAA 204
Peanut AAAACTTTTGTTGAAGCAAAAATAAACCCTAAAAATATAGATTTAGTAGCAGTAACTCAA 222
Group CAAGCTTTGGAAGAAGCTAAAACGACTCCCCAAGAAATAGATTTAGTAGCGGTCACGCAA 111
** * * ** * * ** * * ** ** ** ** ** * ** ***
Blueberry GGACCTGGTTTAGTAGGTTCGTTGTTAGTGGGTATTAATGCCGCTAATGTTTTTGCCTAC 142
Tomato GGACCTGGTTTAGTGGGTTCGTTGTTAGTGGGCATTAACGCCGCTAATGTTTTCGCCTAC 191
Clover GGACCTGGTTTAGTAGGTTCGTTGTTAGTGGGTATTAACGCCGCTAATGTTTTTGCCTAC 300
Ipomoea GGGCCTGGTTTAGTAGGTTCTTTGCTAGTTGGCATTAACGCCGCTAATGTTTTTGCCTAC 228
Maize GGACCTGGTTTGGTAGGTTCGTTGCTAGTTGGCATTAACGCCGCTAATGTTTTTGCCTAC 212
Paulownia GGACCTGGTTTGGCAGGTTCGTTGCTAGTTGGTATTAACGCTGCTAATGTTTTTGCCTAC 225
Aster GGACCTGGTTTGGTAGGTTCGTTGCTAGTTGGCATTAACGCCGCTAATGTTTTTGCCTAC 199
Candidatus GGACCAGGTTTAATTGGTTCTTTGTTGGTAGGTATTAATTGCGCTTTGGTTTTTGGTTAT 249
ulmi GGCCCAGGTTTAATAGGTTCTTTATTTGCTGGTGTTAATGTCGCAAACACTTTTGCTTAC 264
Peanut GGTCCAGGATTAATAGGATCGTTATTATTGGGTGTTAGTGCTGCCAATACTTGGTCTTAT 282
Group GGACCAGGTTTAATCGGTTCTTTATTGTTGGGTATCAATGCTGCTAATACTTTCGCCTAT 171
** ** ** ** ** ** ** * ** * * ** ** **
Blueberry ACTTATCAAAAACCTCTTTTGGGAGTAAATCATTTATTAGGGCATATCTATTCTGCTCAA 202
Tomato ACTTATAAAAAGCCTCTTTTGGGAGTAAATCATTTATTAGGGCATATCTATTCTGCTCAA 251
Clover ACTTATAAAAAGCCTCTTTTGGGAGTAAATCATTTATTAGGTCATATCTATTCTGCTCAA 360
Ipomoea ACTTATCAAAAGCCTCTTTTGGGAGTAAATCATTTATTAGGGCATATCTATTCTGCTCAA 288
Maize ACTTATCAAAAGCCTCTTTTGGGAGTAAATCATTTATTAGGGCATATCTATTCTGCTCAA 272
Paulownia ACTTATCAAAAGCCTCTTTTGGGAGTAAATCATTTATTAGGGCATATCTATTCTGCTCAA 285
Aster ACTTATCAAAAGCCTCTTTTGGGAGTAAATCATTTATTAGGGCATATCTATTCTGCTCAA 259
Candidatus ATTTATAAAAAACCAGTTTTAGGTGTTAATCATTTGTTAGGACATATTTATGCAGCACAA 309
ulmi ATTTATGATAAACCTTTAATAGGTGTTAATCATTTGATAGGCCATATTTATTCTTCTCAA 324
Peanut ATTTATAAAAAACCTTTAATGGGAGTAAATCATTTAATGGGTCATATTTACTCTGTTCAA 342
Group ATTCATCAAAAACCTTTAATAGGGGTTAATCATTTGATGGGGCACCTTTATTCCGTTCAA 231
* * ** * ** ** * * ** ** ******** * ** ** * ** * ***
Blueberry ATTGAACATGAAATTAAATTTCCTGCCTTAGTGCTTTTAGTTTCTGGAGGCCACACCGAT 262
Tomato ATTGAACATGAAATTAAATTTCCTGCCTTAGTACTTTTAGTTTCTGGAGGCCACACCGAT 311
Clover ATTGAACATGAAATTAAATTTCCTGCTTTGGTGCTTTTAGTTTCTGGAGGACACACCGAT 420
Ipomoea ATTGAACATGAAATTAAATTTCCTGCCTTAGTACTTTTAGTTTCTGGAGGACACACCGAT 348
Maize ATTGAACATGAAATTAATTTTCCTGCCTTAGTACTTTTAGTTTCTGGAGGACACACCGAT 332
Paulownia ATTGAACATGAAATTAATTTTCCTGCCTTAGTACTTTTAGTTTCTGGAGGACACACCGAT 345
Aster ATTGAACATGAAATTAATTTTCCTGCCTTAGTACTTTTAGTTTCTGGAGGACACACCGAT 319
Candidatus ATAGAAAATGAAATTGAGTTTCCTTCACTAGTTTTGATTATTTCAGGTGGACATACAGAA 369
ulmi ATAGAAAATGAAATAAAATTTCCTTCTTTAGTTCTTTTGATTTCAGGAGGACATACGGAA 384
Peanut ATAGAACATGAGATAGAATTTCCTGCTTTAGCTCTAATTGTTTCAGGAGGACATACAGAA 402
Group ATAAAAAACGAAATTAAATTCCCAGCTTTAGCGCTTTTAATTTCGGGAGGTCATACTGAA 291
** ** * ** ** * ** ** * * * * * **** ** ** ** ** **
Blueberry CTTTTTTATCTTACGGATCATCTCCAAATAAAACCTTTGGGCACTACTCTTGATGATGCA 322
Tomato CTTTTTTATCTTACGGATCATCTCCAAATCAAACCTTTGGGTACTACTATTGATGATGCA 371
Clover CTTTTTTATCTTACGGATCATCTCCAAATTAAACCTTTGGGCACTACTCTTGATGATGCA 480
Ipomoea CTTTTTTATCTTACGGACCACCTCCAAATCAAACCTCTTGGCACTACTCTTGATGATGCA 408
Maize CTTTTTTATCTTACGGACCACCTCCAAATCAAACCTCTTGGCACTACTCTTGATGATGCA 392
Paulownia CTTTTTTATCTTACGGACCACCTCCAAATCAAACCTCTTGGCACTACTCTTGATGATGCG 405
Aster CTTTTTTATCTTACGGACCACCTCCAAATCAAACCTCTTGGCACTACTCTTGATGATGCG 379
Candidatus TTATTAGCTTTAGAAAATTATTTACAAATTAAAAAGTTAGGTTTTACTTGTGATGATGCT 429
ulmi TTGTTTTATTTTAAGGATCACTTTCAAATTAAAGAAATCGGTACTACTTTAGATGACGCA 444
Peanut TTAATTTATTTAAATAATCATTTTGATATACAGAAATTAGGAGCTACTTTAGATGATGCT 462
Group TTAATTTATATAGAAGATCATTTTAAAATGAAACATATTGGAACTACTTTAGATGATGCC 351
* * * * * * * * ** * * ** **** ***** **
Blueberry GTAGGAGAAGTTTATGATAAAATTGCTAAAAACCTTAATTTGCCTTATCCTGGAGGACCT 382
Tomato GTAGGAGAAGTTTATGATAAAATTGCTAAAAACCTTAATTTGCCTTATCCTGGAGGACCT 431
Clover GTAGGAGAAGTTTATGATAAAATTGCTAAAAAACTTAATTTTCCTTATCCCGGAGGACCT 540
Ipomoea GTAGGAGAAGTTTATGATAAAATTGCTAAAAGCCTTAATCTGCCTTATCCTGGAGGACCT 468
Maize GTAGGAGAAGTTTATGATAAAATTGCTAAAAACCTCAATCTGCCTTATCCTGGAGGACCT 452
Paulownia GTAGGAGAAGTTTATGATAAAATTGCTAAAAACCTCAATCTGCCTTATCCTGGAGGACCT 465
Aster GTAGGAGAAGTTTATGATAAAATTGCTAAAAACCTCAATCTGCCTTATCCTGGAGGACCT 439
Candidatus GTTGGAGAAGCTTATGATAAAGTTTCCAGAATTTTAGGTTTTGGTTATCCTGGAGGACCT 489
ulmi GTAGGTGAAATTTATGATAAAATTTCTAGAACTTTAAATTTAGGTTATCCTGGAGGTCCT 504
Peanut GTTGGTGAAGTTTATGATAAAGTTGCTAAAAATTTAAATTTAAATTATCCTGGTGGTCCT 522
Group GTTGGGGAAGTTTATGATAAAGTCGCTAAAACTTTACAATTAGATTATCCTGGCGGTCCA 411
** ** *** ********** * * * ** * * ****** ** ** **
Blueberry TTGATTGATCAATTAGCCCAACAAGGAAAAGACACTTATCATCTTGTACGTCCTTATTTA 442
Tomato TTGATTGATCAATTAGCCCAACAAGGAAAAGACACTTATCATCTGGTACGTCCTTATTTA 491
Clover TTGATTGATCAATTAGCCCAACAAGGAAAAGACACTTATCATCTGGTACGTCCTTATTTA 600
Ipomoea TTGATTGATCAATTAGCCCAACAAGGAAAAGACACTTATCATCTGGTGCGCCCTTATTTA 528
Maize TTGATTGATCAATTAGCCCAACAAGGAAAAGACACTTATCATTTGGTGCGCCCTTATTTA 512
Paulownia TTGATTGATCAATTAGCCCAACAAGGAAAAGACACTTATCATTTGGTGCGCCCTTATTTA 525
Aster TTGATTGATCAATTAGCCCAACAAGGAAAAGACACTTATCATTTGGTGCGCCCTTATTTA 499
Candidatus ATTATCGATGAATTAGCTCAAAAAGGTAAAGATATTTTTAATTTTGTTCGTCCGTATTTA 549
ulmi ATAATTGAAAAATTAGCATCAAAAGGAGAAAATTTATTTTTATTTCCGCGCCCTTATTTA 564
Peanut ATTATAGAAAAACTCGCTCTTAAAGGCGAATCTGTTTTTAAATTAACATTACCTTATATT 582
Group ATAATTGAAAAATTATCTTTACAAGGGAAAGATATTTTTAATTATCCTCGCCCTTATTTA 471
* ** ** ** * * **** ** * * ** *** *
Blueberry AAAAATGATAATCTTAATTTTAGTTTTTCAGGATTAAAAAGTAATTTGGTAAATTTAGTG 502
Tomato AAAAATGACAATCTTAATTTTAGTTTTTCAGGATTAAAAAGTACTTTGGTAAATTTAGTG 551
Clover AAAAATGATGATCTTAATTTTAGTTTTTCAGGATTAAAAAGTACTTTGGTAAATTTAGTG 660
Ipomoea AAAAATGATAATCTGAATTTTAGTTTTTCAGGACTCAAAAGCACTTTGTTAAATTTAGTG 588
Maize AAAAATGATAATCTGAATTTTAGTTTTTCAGGACTCAAAAGCACTTTGGTAAATTTAGTG 572
Paulownia AAAAAAGATAATCTGAATTTTAGTTTTTCAGGACTCAAAAGCACTTTGGTAAATTTAGTG 585
Aster AAAAATGATAATCTGAATTTTAGTTTTTCAGGACTCAAAAGCACTTTGGTAAATTTAGTG 559
Candidatus AAAAATGATAATTTTAATTTTAGTTTTTCTGGTCTTAAAAGTTCAATATTTAATTTAGTT 609
ulmi AAAAATAAAAATTTAAATTTTAGTTTTTCAGGTTTAAAAAGCAAAATTATAAATTTTATT 624
Peanut AAAAATAATAATTTGGATTTTAGTTTTTCAGGATTAAAAAGTCAAATTATTAATTTAATC 642
Group AAGAATAAAAATTTAAATTTTAGTTTTTCTGGTTTAAAAAGTAAAATCATTAATTCTATC 531
** ** * ** * ************* ** * ***** * * **** *
Blueberry ATGAAACAAAACCTAAAAGA------TATCAACATTCCTGATTTATGTGTTTCTTTTCAA 556
Tomato ATGAAGCAAAACCTAAAAGA------TATCAATATTCCTGATTTATGCGCTTCTTTTCAA 605
Clover ATGAAACAAAACCTAAAAGA------TATTAAAATTCCTGATTTATGTGCTTCTTTTCAA 714
Ipomoea ATGAAACAAAACCTAAAAGA------TATCAACATTCCTGATTTGTGCGCTTCTTTTCAA 642
Maize ATGAAACAAAACCTAAAAGA------TATCCACATTCCTGATTTGTGCGCTTCTTTTCAA 626
Paulownia ATGAAACAAAACCTAAAAGA------TATCAACATTCCTGATTTGTGCGCTTCTTTTCAA 639
Aster ATGAAACAAAACCTAAAATA------TATCAACATTCCTGATTTGTGCGCTTCTTTTCAA 613
Candidatus TCTAAAAATAATTTTAATTT------ACAAGAAAAAATAAATATTTGTAGTTCTTTTCAA 663
ulmi AATAAAAGAAAA---AATAT---TGATTCAGATATTAATAACATTTGTGCTTCTTTTCAA 678
Peanut AATCAAAATAGTCTTAATATGTCTAACAAATTTATTTATGATATATGCGCTTCTTTTCAA 702
Group GATCATCAAAA----AATGTCTTTA--CAATATAAAAGTGATATTGCGGCTTCTTTTCAA 585
* * ** * * * **********
Blueberry GCCAGCGTTATTGATGTTTTATATGAAAAAACCAAAAGAGCTTTAACCAAATATCCTGTT 616
Tomato ACCAGCGTTATTAATGTTTTGTGTGAAAAAACCAAAAGAGCTTTAACCAAATATCATGTT 665
Clover GCCAGTGTTATTGATGTTTTATATGAAAAAACCAAAAGAGCTTTAACCAAATATCCTGTT 774
Ipomoea GCTAGTGTTATTGATGTTTTATATGAAAAAACTAAAAGAGCTTTAACCAAATATCACACT 702
Maize GCTAGTGTTATTGATGTTTTATATGAAAAAACTAAAAGAGCTTTAAACAAATATCGTGCT 686
Paulownia GCTAGTGTTATTGATGTTTTATATGAAAAAACTAAAAGAGCTTTAAACCAATATCGCACT 699
Aster GCTAGTGTTATTGATGTTTTATATGAAAAAACTAAAAGAGCTTTAACCAAATATCGTGCT 673
Candidatus TCTAGTGTTATTGATGTTTTGGTAGAAAAAACAAAGAGAGTTTTGAAAAAATATTCTTTT 723
ulmi TCTAGTGTCGCAGATGTTTTAATAACAAAAACTAAAAGAGCTTTAAATTTATATCCTTCT 738
Peanut AAAGTAGTTATTGAGGTTTTATTAATTAAAATAAAAAGAGCTTTAAAAAAATTTCCTACT 762
Group GCTAGTATCACAGAGGTATTAGTCGAAAAAACCCAAAGAGCGATGAAAATGTATCCCGTA 645
* * ** ** **** * **** * * * *
Blueberry AAACAATTAATTGTTACTGGTGGAGTTGCTTCTAATTCCGGTTTAAGACAAAAGTTTATG 676
Tomato AAACAATTAATTGTTGTTGGTGGAGTTGCTTCTAATTCTGGTTTAAGACAAAAGTTTATG 725
Clover AAACAATTAATTGTTACTGGTGGAGTTGCTTCTAATTCTGGTTTAAGACAAAAGTTTATG 834
Ipomoea AAACAATTAATTGTTACTGGTGGAGTTGCTTCTAATTTTGGTTTAAGACAAAAGTTTA-- 760
Maize AAACAATTAATTGTTACTGGTGGAGTTGCTTCTAATTCTGGTT----------------- 729
Paulownia AAACAATTAATTGTTACTGGTGGAGTTGCTTCTAATTCTGGTTTAAGACAAAAGTTTATG 759
Aster AAACAATTAATTGTTACTGGTGGAGTTGCTTCTAATTCTGGTTTAAGACAAAAGTTTATG 733
Candidatus AAGCAGTTAATTATTACAGGTGGCGTTGCTGCTAATTATAGTTTAAGAAAAAGATTTTTA 783
ulmi AAAGAGTTAATAATTGTAGGTGGAGTAGCTTCTAATCAATTTTTGAAAAATCAATTTAAA 798
Peanut AAAAACTTAATTTTAGTAGGAGGTGTAGCTT----------------------------- 793
Group AACCAACTCCTTATAGTAGGCGGAGTGGCGGCTAATCAGTTTTTAATCAATAGCTTTAAA 705
** * * * * ** ** ** **
Blueberry ACATCTTTTTCTAACTTGGAAGTTATTTTTCCTAGTTTACAAT----------------- 719
Tomato ACATCTTTTTCTAACTTGGAAGTTATTTTTCCTAGTTTACAATA---------------- 769
Clover ACATCTTTTTCTAACTCGGAAGTTATTTTCCCTAGTTTACAATATTGTACTGATCAAGCT 894
Ipomoea ------------------------------------------------------------
Maize ------------------------------------------------------------
Paulownia ACATCTTTTGCTAACTTGGAAGTTATTTTTCCTAGTTTG--------------------- 798
Aster ACATCTTTTGCTAACTTGGAAGTTATTTTTCCTAGTTTGC-------------------- 773
Candidatus AGTGAATTTTCTCAATTAAAAGTTATTATACCTAG------------------------- 818
ulmi AATGCTTTCCCAGAATTAAGATTGATCATCCCTTCTCCTATATATTGTAC---------- 848
Peanut ------------------------------------------------------------
Group AAAGCTTTTTCTAGAACGGAAATATTAACTCCTAG------------------------- 740
Blueberry ----------------------------------------------
Tomato ----------------------------------------------
Clover GCTATGATAGGAATTGCGGCTTATTATCAGAATCAAATTATCAAAT 940
Ipomoea ----------------------------------------------
Maize ----------------------------------------------
Paulownia ----------------------------------------------
Aster ----------------------------------------------
Candidatus ----------------------------------------------
ulmi ----------------------------------------------
Peanut ----------------------------------------------
Group ----------------------------------------------
