CLUSTAL W Alignment of phytoplasmas elongation factors seq:

strainHYDP        CCATTGACCCGGTAAAACTACTCTTACAGCAGCTATTACCCAAGTTTTGTCTGCTCGTGG 60
strainBB          CCATTGACCCGGTAAAACTACTCTTACAGCAGCTATTACCCAAGTTTTGTCTGCTCGTGG 60
strainIPWB        CCATTGACCCGGTAAAACTACTCTTACAGCAGCTATTACCCAAGTTTTGTCTACTCGTGG 60
strainAV2192      CCATTGACCCGGTAAAACTACTCTTACAGCAGCTATTACCCAAGTTTTGTCTACTCGTGG 60
strainAVUT        CCATTGACCCGGTAAAACTACTCTTACAGCAGCTATTACCCAAGTTTTGTCTACTCGTGG 60
strainDEV         CCATTGACCCGGTAAAACTACTCTTACAGCAGCTATTACCCAAGTTTTGTCTACTCGTGG 60
Asteryellows      CCATTGACCCGGTAAAACTACTCTTACAGCAGCTATTACCCAAGTTTTGTCTACTCGTGG 60
strainIOWB        CCATTGACCCGGTAAAACTACTCTTACAGCAGCTATTACCCAAGTTTTGTCTACTCGTGG 60
strainCVB         CCATTGACCCGGTAAAACTACTCTTACAGCAGCTATTACCCAAGTTTTGTCTACTCGTGG 60
strainAYA         CCATTGACCCGGTAAAACTACTCTTACAGCAGCTATTACCCAAGTTTTGTCTACTCGTGG 60
strainBBS3        CCATTGACCCGGTAAAACCACTCTTACAGCAGCTATTACCCAAGTTTTGTCTACTCGTGG 60
Candidatus        ------------------------------------------------------------
                                                                              

strainHYDP        CTTGGCTAAAAGTAGAGCTTATGACCAAATTGATAATGCTCCTGAA-GAAAGAGAACGTG 119
strainBB          CTTGGCTAAAAGTAGAGCTTATGACCAAATTGATAATGCTCCTGAA-GAAAGAGAACGTG 119
strainIPWB        CTTGGCTAAAAGTAGAGCTTATGATCAAATTGATAATGCTCCTGAA-GAAAGAGAACGTG 119
strainAV2192      CTTGGCTAAAAGTAGAGCTTATGATCAAATTGATAATGCTCCTGAA-GAAGGAGGACGTG 119
strainAVUT        CTTGGCTAAAAGTAGAGCTTATGATCAAATTGATAATGCTCCTGAA-GAAAGAGAACGTG 119
strainDEV         CTTGGCTAAAAGTAGAGCTTATGATCAAATTGATAATGCTCCTGAA-GAAAGAGAACGTG 119
Asteryellows      ATTGGCTAAAAGTAGAGCTTATGATCAAATTGATAATGCTCCTGAA-GAAAGAGAACGTG 119
strainIOWB        CTTGGCTAAAAGTAGAGCTTATGATCAAATTGATAATGCTCCTGAA-GAAAGAGAACGTG 119
strainCVB         ATTGGCTAAAAGTAGAGCTTATGATCAAATTGATAATGCTCCTGAA-GAAAGAGAACGTG 119
strainAYA         ATTGGCTAAAAGTAGAGCTTATGATCAAATTGATAATGCTCCTGAA-GAAAGAGAACGTG 119
strainBBS3        CTTGGCTAAAAGTAGAGCTTATGATCAAATTGATAATGCTCCTGAA-GAAAGAGAACGTG 119
Candidatus        -----------------------------------AAGCGCCTGAAAGAAAAAGAACGTG 25
                                                     * ** ****** ***  ** *****

strainHYDP        GAATTACTATTAAAACTTCACATGTAGAATATGAAACAGAAAAACGTCATTATGCTCATG 179
strainBB          GAATTACTATTAAAACTTCACATGTAGAATATGAAACAGAAAAACGTCATTATGCTCATG 179
strainIPWB        GAATCACTATTAAAACTTCACACGTAGAATATGAAACAGAAAAACGTCACTATGCTCACG 179
strainAV2192      GAATCACTATTAAAACTTCACACGTAGAATATGAAACAGAAAAACGTCACTATGCTCACG 179
strainAVUT        GAATCACTATTAAAACTTCACACGTAGAATATGAAACAGAAAAACGTCACTATGCTCACG 179
strainDEV         GAATCACTATTAAAACTTCACACGTAGAATATGAAACAGAAAAACGTCACTATGCTCACG 179
Asteryellows      GAATCACTATTAAAACTTCACACGTAGAATATGAAACAGAAAAACGTCACTATGCTCACG 179
strainIOWB        GAATCACTATTAAAACTTCACACGTAGAATATGAAACAGAAAAACGTCACTATGCTCACG 179
strainCVB         GAATTACTATTAAAACTTCACATGTAGAATATGAAACAGAAAAACGTCACTATGCTCACG 179
strainAYA         GAATTACTATTAAAACTTCACATGTAGAATATGAAACAGAAAAACGTCACTATGCTCACG 179
strainBBS3        GAATTACTATTAAAACTTCACACGTAGAATATGAAACAGAAAAACGTCACAATGCTCACG 179
Candidatus        GTATTACAATTAGTACTTCACATGTAGAATATCAAACATCTAAAAGACATTATGCTCATG 85
                  * ** ** ****  ******** ********* *****   *** * **  ******* *

strainHYDP        TTGACTGTCCTGGACACGCCGATTATGTTAAAAACATGATTACTGGAGCTGCTCAAATGG 239
strainBB          TTGACTGTCCTGGACACGCCGATTATGTTAAAAACATGATTACTGGAGCTGCTCAAATGG 239
strainIPWB        TTGACTGTCCTGGACACGCCGATTATGTTAAAAACATGATTACTGGTGCTGCTCAAATGG 239
strainAV2192      TTGACTGTCCTGGACACGCCGATTATGTTAAAAACATGATTACTGGTGCTGCTCAAATGG 239
strainAVUT        TTGACTGTCCTGGACACGCCGATTATGTTAAAAACATGATTACTGGTGCTGCTCAAATGG 239
strainDEV         TTGACTGTCCTGGACACGCCGATTATGTTAAAAACATGATTACTGGTGCTGCTCAAATGG 239
Asteryellows      TTGACTGTCCTGGACACGCCGATTATGTTAAAAACATGATTACTGGTGCTGCTCAAATGG 239
strainIOWB        TTGACTGTCCTGGACACGCCGATTATGTTAAAAACATGATTACTGGTGCTGCTCAAATGG 239
strainCVB         TTGACTGTCCTGGACACGCCGATTATGTTAAAAACATGATTACTGGTGCTGCTCAAATGG 239
strainAYA         TTGACTGTCCTGGACACGCCGATTATGTTAAAAACATGATTACTGGTGCTGCTCAAATGG 239
strainBBS3        TTGACTGTCCTGGACACGCCGATTATGTTAAAAACATGATTACTGGTGCTGCTCAAATGG 239
Candidatus        TGGATTGTCCTGGACATGCAGATTATATTAAAAATATGATTACTGGAGCTGCTCAAATGG 145
                  * ** *********** ** ****** ******* *********** *************

strainHYDP        ATGCTGCTATTTTAGTTGTTTCTGGTGCAGATAGTGTTATGCCTCAAACTAGAGAACACA 299
strainBB          ATGCTGCTATTTTAGTTGTTTCTGGTGCAGATAGTGTTATGCCTCAAGCTAGAGAACACA 299
strainIPWB        ATGCTGCTATTTTAGTTGTTTCTGGTGCAGATAGTGTTATGCCTCAAACTAGAGAACACA 299
strainAV2192      ATGCTGCTATTTTAGTTGTTTCTGGTGCAGATAGTGTTATGCCTCAAACTAGAGAACACA 299
strainAVUT        ATGCTGCTATTTTAGTTGTTTCTGGTGCAGATAGTGTTATGCCTCAAACTAGAGAACACA 299
strainDEV         ATGCTGCTATTTTAGTTGTTTCTGGTGCAGATAGTGTTATGCCTCAAACTAGAGAACACA 299
Asteryellows      ATGCTGCTATTTTAGTTGTTTCTGGTGCAGATAGTGTTATGCCTCAAACTAGAGAACACA 299
strainIOWB        ATGCTGCTATTTTAGTTGTTTCTGGTGCAGATAGTGTTATGCCTCAAACTAGAGAACACA 299
strainCVB         ATGCTGCTATTTTAGTTGTTTCTGGTGCAGATAGCGTTATGCCTCAAACTAGAGAACACA 299
strainAYA         ATGCTGCTATTTTAGTTGTTTCTGGTGCACATAGCGTTATGCCTCAAACTAGAGAACACA 299
strainBBS3        ATGCTGCTATTTTAGTTGTTTCTGGTGCGGATAGTGTTATGCCTCAAACTAGAGAACACA 299
Candidatus        ATGCAGGTATTTTAGTGGTTTCTGCTGTGGATGGTGTTATGCCGCAAACAAAAGAACATA 205
                  **** * ********* ******* **   ** * ******** *** * * ****** *

strainHYDP        TTTTATTAGCACGCCAAGTTGGTGTTCCAAAAATTGTTGTTTTCTTAAATAAATGTGATC 359
strainBB          TTTTATTAGCACGCCAAGTTGGTGTTCCAAAAATTGTTGTTTTCTTAAATAAATGTGATC 359
strainIPWB        TTTTATTAGCGCGCCAAGTTGGTGTTCCAAAAATTGTTGTTTTCTTAAATAAATGTGATC 359
strainAV2192      TTTTATTAGCGCGCCAAGTTGGTGTTCCAAAAATTGTTGTTTTCTTAAATAAATGTGATC 359
strainAVUT        TTTTATTAGCGCGCCAAGTTGGTGTTCCAAAAATTGTTGTTTTCTTAAATAAACGTGATC 359
strainDEV         TTTTATTAGCGCGCCAAGTTGGTGTTCCAAAAATTGTTGTTTTCTTAAATAAATGTGATC 359
Asteryellows      TTTTATTAGCGCGCCAAGTTGGTGTTCCAAAAATTGTTGTTTTCTTAAATAAATGTGATC 359
strainIOWB        TTTTATTAGCGCGCCAAGTTGGTGTTCCAAAAATTGTTGTTTTCTTAAATAAATGTGATC 359
strainCVB         TTTTATTAGCACGCCAAGTTGGTGTTCCAAAAATTGTCGTTTTCTTAAATAAATGTGATC 359
strainAYA         TTTTATTAGCACGCCAAGTTGGTGTTCCAAAAATTGTTGTTTTCTTAAATAAATGTGATC 359
strainBBS3        TTTTATTAGCACGTCAAGTTGGTGTTCCAAAAATTGTTGTTTTCTTAAATAAATGTGATC 359
Candidatus        TTTTACTTGCAAAACAAGTAGGTGTTCCGAAATTATTAGTTTTTTTAAATAAATGTGATA 265
                  ***** * **    ***** ******** *** *  * ***** ********* ***** 

strainHYDP        TTTCCCCAGACGAACAAATTTTAGAATTAGTAGAAATGGAAGTTCGCGAATTATTATCTC 419
strainBB          TTTCCCCAGACGAACAAATTTTAGAATTAGTAGAAATGGAAGTTCGCGAATTATTGTCTC 419
strainIPWB        TTTCCCCAGACGAACAAATTTTAGAATTAGTAGAAATGGAAGTTCGTGAATTATTATCTC 419
strainAV2192      TTTCCCCAGACGAACAAATTTTAGAATTAGTAGAAATGGAGGTTCGTGAATTATTATCTC 419
strainAVUT        TTTCCCCAGACGAACAAATTTTAGAATTAGTAGAAATGGAAGTTCGTGAATTATTATCTC 419
strainDEV         TTTCCCCAGACGAACAAATTTTAGAATTAGTAGAAATGGAAGTTCGTGAATTATTATCTC 419
Asteryellows      TTTCCCCAGACGAACAAATTTTAGAATTAGTAGAAATGGAAGTTCGTGAATTATTATCTC 419
strainIOWB        TTTCCCCAGACGAACAAATTTTAGAATTAGTAGAAATGGAAGTTCGTGAATTATTATCTC 419
strainCVB         TTTCGCCAGACGAACAAATTTTAGAATTAGTAGAAATGGAAGTTCGTGAATTATTATCTC 419
strainAYA         TTTCGCCAGACGAACAAATTTTAGAATTAGTAGAAATGGAAGTTCGTGAATTATTATCTC 419
strainBBS3        TTTCCCCAGACGAACAAATTTTAGAATTAGTAGAAATGGAAGTTCGTGAATTATTATCTC 419
Candidatus        TGATTGAAGATGAAGAAATTTTGGAAGTGGTAGAATTAGAAATTAGAGATGTTTTATCTT 325
                  *      *** *** ******* *** * ****** * **  ** * **  * ** *** 

strainHYDP        AATACGATTTCCCAGGAGATGACATCCCTGACATTAGAGGATCTGCATTAAAAGCTTTAG 479
strainBB          AATACGATTTCCCAGGAGATGACATCCCTGTCATTAGAGGATCTGCATTAAAAGCTTTAG 479
strainIPWB        AATACGATTTCCCAGGAGACGACATTCCTGTTATCAGAGGATCTGCATTAAAAGCTTTAG 479
strainAV2192      AATACGATTTCCCAGGAGACGACATTCCTGTTATTAGAGGATCTGCATTAAAAGCTTTAG 479
strainAVUT        AATACGATTTCCCAGGAGACGACATTCCTGTTATTAGAGGATCTGCATTAAAAGCTTTAG 479
strainDEV         AATACGATTTCCCAGGAGACGACATTCCTGTTATTAGAGGATCTGCATTAAAAGCTTTAG 479
Asteryellows      AATACGATTTCCCAGGAGACGACATTCCTGTTATTAGAGGATCTGCATTAAAAGCTTTAG 479
strainIOWB        AATACGATTTCCCAGAAGACGACATTCCTGTTATTAGAGGATCTGCATTAAAAACTTTAG 479
strainCVB         AATACGATTTCCCAGGAGATGATATTCCTGTTATTAGAGGATCTGCATTAAAAGCTTTAG 479
strainAYA         AATACGATTTCCCAGGAGATGATATTCCTGTTATTAGAGGATCTGCATTAAAAGCTTTAG 479
strainBBS3        AATATGATTTCCCAGGAGATGAAATTCCTGTTATTAGAGGATCTGCATTAAAAGCTTTAG 479
Candidatus        CTAATGGTTTTGATACTGATAACATGCCTATTATTAGAGGCTCTGCTTTAAAATCTATCG 385
                     * * ***       **  * ** ***   ** ***** ***** ****** ** * *

strainHYDP        AAGGTGATGCTCATTACGTTGCTCAAGTAAATAAATTAATCGAAACTCTAGACACCTACA 539
strainBB          AAGGTGATGCTCATTACGTTGCTCAAGTAAATAAATTAATCGAAACTCTAGACACCTACA 539
strainIPWB        AAGGTGACGCTCATTACGTTGCTCAAGTAAACGAATTAATCGAAACTCTAGACACCTACA 539
strainAV2192      AAGGTGACGCTCATTACGTTGCTCAAGTAAACGAATTAATCGAAACTCTAGACACCTACA 539
strainAVUT        AAGGTGACGCTCATTACGTTGCTCAAGTAAACGAATTAATCGAAACTCTAGACACCTACA 539
strainDEV         AAGGTGACGCTCATTACGTTGCTCAAGTAAACGAATTAATCGAAACTCTAGACACCTACA 539
Asteryellows      AAGGTGACGCTCATTACGTTGCTCAAGTAAACGAATTAATCGAAACTCTAGACACCTACA 539
strainIOWB        AAGGTGACGCTCATTACGTTTCTCAAGTAAACAAATTAATCGAAACTCTAGACACCTACA 539
strainCVB         AAGGTGACGCTCATTACGTTGCTCAAGTAAACGAATTAATCGAAACTCTAGACACCTACA 539
strainAYA         AAGGTGATGCTCATTACGTTGATAAAGTAAATGAATTAATCGAAACTCTAGACACATACA 539
strainBBS3        AAGGTGACGCTCATTATGTTGCTCAATTAAATGAATTAATCGAAACTCTAGACACCTACA 539
Candidatus        AAGGTCAAGAAAAATATGTTAAAAGTATAGAAGAATTACTGAATGCTTTAGATACATATA 445
                  ***** * *   * ** ***       ** *  ***** *  *  ** **** ** ** *

strainHYDP        TTGAAGACCCAGTGCGTGAAGTTGACAAACCTTTCTTAATGCCTGTAGAAGATGTTTTCA 599
strainBB          TTGAAGACCCAGTGCGTGAAGTTGACAAACCTTTCTTAATGCCTGTAGAAGATGTTTTCA 599
strainIPWB        TTGAAGACCCGGTGCGCGAAGTTGACAAACCTTTCTTAATGCCTGTAGAAGATGTTTTCA 599
strainAV2192      TTGAAGACCCGGTGCGCGAAGTTGACAAACCTTTCTTAATGCCTGTAGAAGATGTTTTCA 599
strainAVUT        TTGAAGACCCGGTGCGCGAAGTTGACAAACCTTTCTTAATGCCTGTAGAAGATGTTTTCA 599
strainDEV         TTGAAGACCCGGTGCGCGAAGTTGACAAACCTTTCTTAATGCCTGTAGAAGATGTTTTCA 599
Asteryellows      TTGAAGACCCGGTGCGCGAAGTTGACAAACCTTTCTTAATGCCTGTAGAAGATGTTTTCA 599
strainIOWB        TTGAAGACCCGGCGCGCGAAGTTGACAAACCTTTCTTAATGCCTGTAGAAGATGTTTTCA 599
strainCVB         TTGAAGACCCGGTGCGCGAAGTTGACAAACCTTTCTTAATGCCTGTAGAAGATGTTTTCA 599
strainAYA         TTGAAGACCCAGTGCGTGAAGTTGATAAACCTTTCTTAATGCCTGTAGAAGATGTTTTCA 599
strainBBS3        TTGAAGACCCAGTTCGTGAAGTTGACAAGCCTTTTTTAATGCCTGTAGAAGATGTTTTCA 599
Candidatus        TTGAAGATCCTGTACGTGATTTAGACAAACCTTTTTTAATGCCTATTGAAGGTGTTATAA 505
                  ******* ** *  ** **  * ** ** ***** ********* * **** **** * *

strainHYDP        CTATTACTGGTAGAGGAACTGTTGTTACTGGTAGAGTAGAAAGAGGCCAAGTAAAAGCTG 659
strainBB          CTATTACTGGTAGAGGAACTGTTGTTACTGGTAGAGTAGAAAGAGGCCAAGTAAAAGCTG 659
strainIPWB        CTATTACTGGTAGAGGAACTGTTGTTACTGGTAGAGTAGAAAGAGGTCAAGTAAAAGCTG 659
strainAV2192      CTATTACTGGTAGAGGAACTGTTGTTACTGGTAGAGTAGAAAGAGGTCAAGTAAAAGCTG 659
strainAVUT        CTATTACTGGTAGAGGAACTGTTGTTACTGGTAGAGTAGAAAGAGGTCAAGTAAAAGCTG 659
strainDEV         CTATTACTGGTAGAGGAACTGTTGTTACTGGTAGAGTAGAAAGAGGTCAAGTAAAAGCTG 659
Asteryellows      CTATTACTGGTAGAGGAACTGTTGTTACTGGTAGAGTAGAAAGAGGTCAAGTAAAAGCTG 659
strainIOWB        CTATTACTGGTAGAGGAACTGTTGTTACTGGTAGAGTAGAAAGAGGTCAAGTAAAAGCTG 659
strainCVB         CTATCACTGGTAGAGGAACTGTTGTTACTGGTAGAGTAGAAAGAGGCCAAGTAAAAGCTG 659
strainAYA         CTATTACTGGTAGAGGAACTGTTGTTACTGGTAGAGTAGAAAGAGGCCAAGTAAAAGCTG 659
strainBBS3        CTATTACTGGTAGAGGAACTGTTGTTACTGGTAGAGTAGAAAGAGGCAAAGTAAAAGCTG 659
Candidatus        ATGTTAAAGGAAGAGGTACTGTAGCAACAGGACGTGTAGAAAGAGGACAAATTAAACTTT 565
                   * * *  ** ***** ***** *  ** **  * ***********  ** * ***  * 

strainHYDP        GTGATGAAGTAGAAATCGTAGGACTTAAAGAAACTAGAAAAACTATTGTAACTGCAGTAG 719
strainBB          GTGATGAAGTAGAAATCGTAGGACCTAAAGAAACTAGAAAAACTATTGTAACTGCAGTAG 719
strainIPWB        GTGATGAAGTAGAAATCGTAGGACTTAAAGAAACTAGAAAAACTATTGTAACTGCAGTAG 719
strainAV2192      GTGATGAAGTAGAAATCGTAGGACTTAAAGAAACTAGAAAAACTATTGTAACTGCAGTAG 719
strainAVUT        GTGATGAAGTAGAAATCGTAGGACTTAAAGAAACTAGAAAAACTATTGTAACTGCAGTAG 719
strainDEV         GTGATGAAGTAGAAATCGTAGGACTTAAAGAAACTAGAAAAACTATTGTAACTGCAGTAG 719
Asteryellows      GTGATGAAGTAGAAATCGTAGGACTTAAAGAAACTAGAAAAACTATTGTAACTGCAGTAG 719
strainIOWB        GTGATGAAGTAGAAATCGTAGGACTTAAAGAAACTAGAAAAACTATTGTAACTGCAGTAG 719
strainCVB         GTGATGAAGTAGAAATCGTAGGACTTAAAGAAACTAGAAAAACTATTGTAACTGCAGTAG 719
strainAYA         GTGATGAAGTAGAAATCGTAGGACTTAAAGAAACTAAAAAAACTATTGTAACTGCAGTAG 719
strainBBS3        GTGATGAAGTAGAAATCATAGGACTTAAAGAAACTAGAAAAACTATTGTAACTGCAGTAG 719
Candidatus        CTGAAGAAGTAGAAATTTTAGGAATTAAAGAAACACAAAAATCTATAGTAACTGGTTTAC 625
                   *** ***********  *****  *********   **** **** *******   ** 

strainHYDP        AAATGTTTAACAAAGATCTAGAATT------TGCTCAAGCAGGTGACAACGTTGGAGCTT 773
strainBB          AAATGTTTAAAAAAGATCTAGAATT------TGCTCAAGCAGGTGACAACGTTGGAGCTT 773
strainIPWB        AAATGTTTAAAAAAGACCTAGATTT------TGCTCAAGCAGGAGACAACGTTGGAGCTT 773
strainAV2192      AAATGTTTAAAAAAGACCTAGATTT------TGCTCAAGCAGGAGACAACGTTGGAGCTT 773
strainAVUT        AAATGTTTAAAAAAGACCTAGATTT------TGCTCAAGCAGGAGACAACGTTGGAGCTT 773
strainDEV         AAATGTTTAAAAAAGACCTAGATTT------TGCTCAAGCAGGAGACAACGTTGGAGCTT 773
Asteryellows      AAATGTTTAAAAAAGACCTAGATTT------TGCTCAAGCAGGAGACAACGTTGGAGCTT 773
strainIOWB        AAATGTTTAAAAAAGACCTAGATTT------TGCTCAAGCAGGAGACAACGTTGGAGCTT 773
strainCVB         AAATGTTTAAAAAAGATCTAGATTT------TGCTCAAGCAGGTGACAACGTTGGAGCTT 773
strainAYA         AAATGTTTAAAAAAGATCTAGATTT------TGCTCAAGCAGGTGACAACGTTGGAGCTT 773
strainBBS3        AAATGTTTAAAAAAGATCTAGATTT------TGCTCAAGCAGGTGACAACGTTGGAGCTT 773
Candidatus        AAATGTTTCATAAAAATTTAGATAAAGAAGGTGCTTATGCTGGTGATAATATTGGTATTT 685
                  ******** * *** *  ****         **** * ** ** ** **  ****   **

strainHYDP        TATTACGCGGAATTAACCGTGAAGATGTACAACGTGGACAAGTTTTAGCTAAACCAGGTT 833
strainBB          TATTACGCGGAATTAACCGTGAAGATGTACAACGTGGACAAGTTTTAGCTAAACCAGGTT 833
strainIPWB        TATTACGTGGAATTAACCGTGAAGACGTACAACGTGGACAAGTTTTAGCTAAACCAGGTT 833
strainAV2192      TATTACGTGGAATTAACCGTGAAGACGTACAACGTGGACAAGTTTTAGCTAAACCAGGTT 833
strainAVUT        TATTACGTGGAATTAACCGTGAAGACGTACAACGTGGACAAGTTTTAGCTAAACCAGGTT 833
strainDEV         TATTACGTGGAATTAACCGTGAAGACGTACAACGTGGACAAGTTTTAGCTAAACCAGGTT 833
Asteryellows      TATTACGTGGAATTAACCGTGAAGACGTACAACGTGGACAAGTTTTAGCTAAACCAGGTT 833
strainIOWB        TATTACGTGGAATTAGCCGTGAAGACGTACAACGTGGACAAGTTTTAGCTAAACCAGGTT 833
strainCVB         TATTACGCGGAATTAACCGTGAAGACGTACAACGCGGACAAGTTTTAGCTAAACCAGGTT 833
strainAYA         TATTACGCGGAATTAACCGTGAAGACGTACAACGCGGACAAGTTTTAGCTAAACCAGGTT 833
strainBBS3        TATTACGCGGAATTAACCGTGAAGACGTAAAACGTGGACAAATTTTAGCTAAACCAGGTT 833
Candidatus        TATTACGTGGCATCA--------------------------------------------- 700
                  ******* ** ** *                                             

strainHYDP        CTGTCAAACCTCATTCTAAATTTATTGCTCAAGTTTATGTTTTAACTAAAGAAGAAGGAG 893
strainBB          CTGTCAAACCTCATTCTAAATTTATTGCTCAAGTTTATGTTTTAACTAAAGAAGAAGGAG 893
strainIPWB        CTGTTAAGCCTCATTCTAAATTTGTTGCTCAAGTTTATGTTTTAACTAAAGAAGAAGGAG 893
strainAV2192      CTGTTAAGCCTCATTCTAAATTTGTTGCTCAAGTTTATGTTTTAACTAAAGAAGAAGGAG 893
strainAVUT        CTGTTAAGCCTCATTCTAAATTTGTTGCTCAAGTTTATGTTTTAACTAAAGAAGAAGGAG 893
strainDEV         CTGTTAAGCCTCATTCTAAATTTGTTGCTCAAGTTTATGTTTTAACTAAAGAAGAAGGAG 893
Asteryellows      CTGTTAAGCCTCATTCTAAATTTGTTGCTCAAGTTTATGTTTTAACTAAAGAAGAAGGAG 893
strainIOWB        CTGTTAAACCTCATTCTAAATTTGTTGCTCAAGTTTATGTTTTAACTAAAGAAGAAGGAG 893
strainCVB         CCGTTAAACCTCATTCTAAATTTGTTGCTCAAGTTTATGTTTTAACTAAAGAAGAAGGGG 893
strainAYA         CCGTTAAACCTCATTCTAAATTTGCTGCTCAAGTTTATGTTTTAACTAAAGAAGAAGGGG 893
strainBBS3        CTGTTAAACCTCATTCTAAATTTGTTGCTCAAGTTTATGTTTTAACTAAAGAAGAAGGAG 893
Candidatus        ------------------------------------------------------------
                                                                              

strainHYDP        GACGTCACACTGCCTTTTTCTCTCAATACCGTCCTCAATTCTATTTCCGTACTACAGATA 953
strainBB          GACGTCACACTGCCTTTTTCTCTCAATACCGTCCTCAATTCTATTTCCGTACTACAGATA 953
strainIPWB        GACGTCACACTGCCTTTTTCTCTCAATACCGTCCTCAATTCTATTTCCGTACTACAGATA 953
strainAV2192      GACGTCACACTGCCTTTTTCTCTCAATACCGTCCTCAATTCTATTTCCGTACTACAGATA 953
strainAVUT        GACGTCACACTGCCTTTTTCTCTCAATACCGTCCTCAATTCTATTTCCGTACTACAGATA 953
strainDEV         GACGTCACACTGCCTTTTTCTCTCAATACCGTCCTCAATTCTATTTCCGTACTACAGATA 953
Asteryellows      GACGTCACACTGCCTTTTTCTCTCAATACCGTCCTCAATTCTATTTCCGTACTACAGATA 953
strainIOWB        GACGTCACACTGCCTTTTTCTCTCAATACCGCCCTCAATTCTATTTCCGTACTACAGATA 953
strainCVB         GACGTCACACTGCCTTTTTCTCTCAATACCGTCCTCAATTCTATTTCCGTACTACAGATA 953
strainAYA         GACGTCACACTGCCTTTTTCTCTCAATACCGTCCTCAATTCTATTTCCGTACTACAGATA 953
strainBBS3        GACGTCACACTGCCTTTTTCTCTCAATACCGTCCTCAATTCTATTTCCGTACTACAGATA 953
Candidatus        ------------------------------------------------------------
                                                                              

strainHYDP        TTACAGGAGTAGTTGAATTACAAGGTGATGTAAAAATGGTAATGCCAGGAGACAACGCTG 1013
strainBB          TTACAGGAGTAGTTGAATTACAAGGTGATGTAAAAATGGTAATGCCAGGAGACAACGCTG 1013
strainIPWB        TTACAGGAGTAGTTGAATTACAAGGTGATGTTAAAATGGTAATGCCAGGTGACAACGCTG 1013
strainAV2192      TTACAGGAGTAGTTGAATTACAAGGTGATGTTAAAATGGTAATGCCAGGTGACAACGCTG 1013
strainAVUT        TTACAGGAGTAGTTGAATTACAAGGTGATGTTAAAATGGTAATGCCAGGTGACAACGCTG 1013
strainDEV         TTACAGGAGTAGTTGAATTACAAGGTGATGTTAAAATGGTAATGCCAGGTGACAACGCTG 1013
Asteryellows      TTACAGGAGTAGTTGAATTACAAGGTGATGTTAAAATGGTAATGCCAGGTGACAACGCTG 1013
strainIOWB        TTACAGGAGTAGTTGAATTACAAGGTGATGTTAAAATGGTAATGCCAGGTGACAACGCTG 1013
strainCVB         TTACAGGAGTAGTTGAATTACAAGGTGATGTAAAAATGGTAATGCCAGGTGACAACGCTG 1013
strainAYA         TTACAGGAGTAGTTGAATTACAAGGTGATGTAAAAATGGTAATGCCAGGTGACAACGCTG 1013
strainBBS3        TTACAGGAGTAGTTGAATTACAAGGCGATGTAAAAATGGTAATGCCAGGTGACAACACTG 1013
Candidatus        ------------------------------------------------------------
                                                                              

strainHYDP        AATTAGTAGTTACCCTGAACAACCCAATTGCCATAGAAGAAGGAACTAAGTTCTCTATTC 1073
strainBB          AATTAGTAGTTACCCTGAACAACCCAATTGCCATAGAAGAAGGAACTAAGTTCTCTATTC 1073
strainIPWB        AATTAGTAGTTACCCTTAACAACCCAATTGCTATCGAAGAAGGAACTAAGTTCTCTATTC 1073
strainAV2192      AATTAGTAGTTACCCTTAACAACCCAATTGCTATCGAAGAAGGAACTAAGTTCTCTATTC 1073
strainAVUT        AATTAGTAGTTACCCTTAACAACCCAATTGCTATCGAAGAAGGAACTAAGTTCTCTATTC 1073
strainDEV         AATTAGTAGTTACCCTTAACAACCCAATTGCTATCGAAGAAGGAACTAAGTTCTCTATTC 1073
Asteryellows      AATTAGTAGTTACCCTTAACAACCCAATTGCTATCGAAGAAGGAACTAAGTTCTCTATTC 1073
strainIOWB        AATTAGTAGTTACCCTTAACAACCCAATTGCTATCGAAGAAGGAACTAAGTTCTCTATTC 1073
strainCVB         AATTAGTAGTTACCCTGAACAACCCAATTGCCATCGAAGAAGGAACTAAGTTCTCTATTC 1073
strainAYA         AATTAGTAGTGACCCTGAACAACCCAATTGCCATCGAAGAAGGAACTAAGTTCTCTATTC 1073
strainBBS3        AATTAGTAATTACCCTGAACAACCCAATTGCCATCGAAGAAGGAACTAAGTTCTCTATTC 1073
Candidatus        ------------------------------------------------------------
                                                                              

strainHYDP        GTGAAGGTGG 1083
strainBB          GTGAAGGTGG 1083
strainIPWB        GTGAAGGTGG 1083
strainAV2192      GTGAAGGTGG 1083
strainAVUT        GTGAAGGTGG 1083
strainDEV         GTGAAGGTGG 1083
Asteryellows      GTGAAGGTGG 1083
strainIOWB        GTGAAGGTGG 1083
strainCVB         GTGAAGGTGG 1083
strainAYA         GTGAAGGTGG 1083
strainBBS3        GTGAAGGTGG 1083
Candidatus        ----------